Тегиздөө упай кантип эсептелет?
Тегиздөө упай кантип эсептелет?

Video: Тегиздөө упай кантип эсептелет?

Video: Тегиздөө упай кантип эсептелет?
Video: ЭРКЕКТИН АЯЛЫН СҮЙБӨЙ КАЛГАНЫН КАНТИП БИЛСЕ БОЛОТ? 5 БЕЛГИ 2024, Ноябрь
Anonim

The упай бир тегиздөө , S, эсептелген алмаштыруунун жана боштуктун суммасы катары упайлар . Алмаштыруу упайлар издөө таблицасы менен берилет (караңыз PAM, BLOSUM). Gap упайлар адатта болуп саналат эсептелген G суммасы катары, боштук ачуу айып жана L, боштук узартуу айып. Узундугу n болгон боштук үчүн боштуктун баасы G+Ln болот.

Демек, тегиздөө упай деген эмне?

Оптималдуу тегиздөө жана тегиздөө упай Оптималдуу тегиздөө болуп саналат тегиздөө эң жогорку берүү упай , жана тегиздөө упай бул эң бийикпи упай . Бул тегиздөө упай X жана Y = упай оптималдуу боюнча X жана Y тегиздөө . Мисалы, тегиздөө упай төмөнкү X жана Y 36 болуп саналат.

Жогорудагыдан тышкары, ырааттуулук кантип иштейт? Биоинформатикада а ырааттуу тегиздөө уюштуруунун бир жолу болуп саналат ырааттуулугу ортосундагы функционалдык, структуралык же эволюциялык мамилелердин натыйжасы болушу мүмкүн болгон окшоштук аймактарын аныктоо үчүн ДНКнын, РНКнын же белоктун ырааттуулугу.

Бул жерде биоинформатикада балл деген эмне?

ырааттуу тегиздөө контекстинде, а упай тегиздөөнүн жалпы сапатын сүрөттөгөн сандык маани. Жогорку сандар жогорку окшоштукка туура келет. The упай масштабына жараша болот балл алуу колдонулган система (алмаштыруу матрицасы, боштук жазасы).

Кезекти тегиздөөдө оптималдуу тегиздөө деген эмне?

The оптималдуу тегиздөө эки белоктун ырааттуулугу болуп саналат тегиздөө бул киргизилген боштуктар үчүн жазаны азайтып, жуп-упайлардын суммасын максималдуу кылат. Динамикалык программалоо мүмкүнчүлүк берет оптималдуу тегиздөө экиден ырааттуулугу мнстептер тартибинде табууга болот, мында m жана n узундуктары ырааттуулугу.

Сунушталууда: